Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8C1R3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms