Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo42Q6PDJ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo42Q6PDJ6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo42Q6PDJ6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo42Q6PDJ6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms