Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms