Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a5Q4LDG0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a5Q4LDG0 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms