Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ankrd27Q3UMR0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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