Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne9Q1RLL3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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