Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tubg1P83887 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tubg1P83887 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms