Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms