Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms