Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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