Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2bO35690 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms