Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam240aJ3QNP9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms