Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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