Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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