Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms