Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700024B05RikE9Q6D7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms