Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms