Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms