Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSPP1Q1MSJ5 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSPP1Q1MSJ5 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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