Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNCBQ16143 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNCBQ16143 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNCBQ16143 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277 ms