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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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134 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
Y_RNA.455-201
ENST00000384230
98 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-587P-201
ENST00000391282
106 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-876P-201
ENST00000391295
104 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.626-201
ENST00000411288
95 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
AL118496.2-201
ENST00000448300
230 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
AC090616.3-202
ENST00000583346
205 nt
TSL 2
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
AC013734.1-201
ENST00000619329
111 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-682P-201
ENST00000363843
106 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
SNORD42.2-201
ENST00000365570
69 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.396-201
ENST00000383949
103 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
MIR4777-201
ENST00000583710
86 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.435-201
ENST00000384095
112 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.527-201
ENST00000384573
102 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
MIR548A3-201
ENST00000385297
97 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RBMX2P4-201
ENST00000441256
376 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
MIR3144-201
ENST00000579460
79 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.58-201
ENST00000362807
102 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-340P-201
ENST00000364005
107 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-645P-201
ENST00000364649
106 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNY3P1-201
ENST00000365085
102 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.352-201
ENST00000365439
102 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.483-201
ENST00000384380
101 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-239P-201
ENST00000390990
99 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
AL035461.1-201
ENST00000421490
332 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
snoU13.10-201
ENST00000459301
103 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
MIR4796-201
ENST00000580742
81 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
SNORD19B.1-201
ENST00000630615
80 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
Y_RNA.11-201
ENST00000362375
109 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-915P-201
ENST00000364943
103 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-1318P-201
ENST00000365389
103 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
RNU6-460P-201
ENST00000391158
108 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
DNAJC19P2-201
ENST00000593340
302 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
NCRUPAR_2.1-201
ENST00000616308
99 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
AL035470.1-201
ENST00000622571
220 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
SNCB
Q16143
MIR369-201
ENST00000362155
70 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNY4P27-201
ENST00000363341
96 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.512-201
ENST00000384518
102 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
SNORD37.2-201
ENST00000391075
66 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-1215P-201
ENST00000384441
102 nt
BASIC
-2.36
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-1219P-201
ENST00000516143
112 nt
BASIC
-2.36
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
U4.2-201
ENST00000618561
85 nt
BASIC
-2.36
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
-2.36
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.375-201
ENST00000365625
101 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MIR1468-201
ENST00000410600
86 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
AL589823.1-201
ENST00000429577
183 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
AL158828.1-201
ENST00000438582
197 nt
TSL 5
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
hsa-mir-4773-1.1-201
ENST00000585225
78 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MTRNR2L9-201
ENST00000622562
75 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.413-201
ENST00000384007
102 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
SNORD116-4-201
ENST00000384733
96 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.754-201
ENST00000476024
102 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-1247P-201
ENST00000516622
98 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
SNORA81.3-201
ENST00000517283
198 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.158-201
ENST00000363651
101 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
SNORD58.1-201
ENST00000391313
66 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MTND2P23-201
ENST00000422990
651 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
AL158147.1-201
ENST00000443970
75 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-1137P-201
ENST00000517073
99 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
127 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.309-201
ENST00000365046
111 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-474P-201
ENST00000384243
107 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-1111P-201
ENST00000391118
107 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-1089P-201
ENST00000516473
104 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
RNU6-861P-201
ENST00000516745
106 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MIR466-201
ENST00000580653
84 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
MIR4680-201
ENST00000580906
66 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SNCB
Q16143
Y_RNA.71-201
ENST00000362892
104 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
Y_RNA.529-201
ENST00000384586
119 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNU6-795P-201
ENST00000516323
103 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
Y_RNA.190-201
ENST00000363964
101 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
SNORD58A-201
ENST00000383875
65 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR548C-201
ENST00000384815
97 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNU7-153P-201
ENST00000516455
62 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR4679-2-201
ENST00000578358
77 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
AC141273.2-201
ENST00000618989
130 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNU6-639P-201
ENST00000384074
107 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
AL450471.1-201
ENST00000447509
127 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
U6.97-201
ENST00000636904
101 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR548AA1-201
ENST00000384971
97 nt
BASIC
-2.44
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
TRAJ33-201
ENST00000390504
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.44
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
Y_RNA.318-201
ENST00000365131
97 nt
BASIC
-2.45
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
-2.45
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNU4-11P-201
ENST00000365287
132 nt
BASIC
-2.45
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR429-201
ENST00000362106
83 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
Y_RNA.29-201
ENST00000362570
113 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNU6-698P-201
ENST00000363523
107 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNU6-34P-201
ENST00000364874
107 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR581-201
ENST00000384895
96 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
Y_RNA.699-201
ENST00000516803
93 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
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