Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATP6AP1Q15904 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATP6AP1Q15904 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATP6AP1Q15904 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATP6AP1Q15904 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.4 ms