Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

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Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1EQ15878 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1EQ15878 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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