Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SIX1Q15475 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SIX1Q15475 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SIX1Q15475 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SIX1Q15475 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SIX1Q15475 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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SIX1Q15475 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SIX1Q15475 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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