Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ODF1Q14990 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ODF1Q14990 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ODF1Q14990 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ODF1Q14990 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms