Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALCAMQ13740 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ALCAMQ13740 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ALCAMQ13740 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 400.4 ms