Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CBX3Q13185 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CBX3Q13185 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CBX3Q13185 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CBX3Q13185 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CBX3Q13185 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
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