Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIAQ12857 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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NFIAQ12857 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFIAQ12857 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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NFIAQ12857 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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NFIAQ12857 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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NFIAQ12857 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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NFIAQ12857 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIAQ12857 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIAQ12857 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFIAQ12857 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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