Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
CENPFP49454 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
CENPFP49454 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
CENPFP49454 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
CENPFP49454 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
CENPFP49454 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
CENPFP49454 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
CENPFP49454 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
CENPFP49454 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-5.22□□□□□ -3.25
CENPFP49454 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
CENPFP49454 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
CENPFP49454 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
CENPFP49454 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
CENPFP49454 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
CENPFP49454 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
CENPFP49454 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
CENPFP49454 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-5.28□□□□□ -3.25
CENPFP49454 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
CENPFP49454 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
CENPFP49454 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
CENPFP49454 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
CENPFP49454 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
CENPFP49454 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
CENPFP49454 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
CENPFP49454 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
CENPFP49454 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-5.31□□□□□ -3.26
CENPFP49454 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-5.31□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
CENPFP49454 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
CENPFP49454 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
CENPFP49454 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
CENPFP49454 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
CENPFP49454 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
CENPFP49454 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
CENPFP49454 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
CENPFP49454 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
CENPFP49454 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
CENPFP49454 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
CENPFP49454 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
CENPFP49454 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
CENPFP49454 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
CENPFP49454 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
CENPFP49454 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
CENPFP49454 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
CENPFP49454 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
CENPFP49454 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
CENPFP49454 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
CENPFP49454 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
CENPFP49454 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
CENPFP49454 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-5.4□□□□□ -3.27
CENPFP49454 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
CENPFP49454 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
CENPFP49454 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
CENPFP49454 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
CENPFP49454 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
CENPFP49454 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
CENPFP49454 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
CENPFP49454 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
CENPFP49454 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
CENPFP49454 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
CENPFP49454 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
CENPFP49454 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
CENPFP49454 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
CENPFP49454 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.28
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