Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD11P31277 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD11P31277 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD11P31277 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD11P31277 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD11P31277 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD11P31277 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD11P31277 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD11P31277 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD11P31277 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD11P31277 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD11P31277 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD11P31277 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD11P31277 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD11P31277 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD11P31277 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD11P31277 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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