Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRBP23467 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRBP23467 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTPRBP23467 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPRBP23467 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.6 ms