Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VPREB1P12018 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
VPREB1P12018 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.1 ms