Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CLDN9O95484 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLDN9O95484 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLDN9O95484 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CLDN9O95484 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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