Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SPG7Q9UQ90 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SPG7Q9UQ90 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPG7Q9UQ90 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SPG7Q9UQ90 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPG7Q9UQ90 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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SPG7Q9UQ90 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SPG7Q9UQ90 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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SPG7Q9UQ90 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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SPG7Q9UQ90 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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