Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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HERPUD2Q9BSE4 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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