Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.6 ms