Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTN1Q16799 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RTN1Q16799 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTN1Q16799 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTN1Q16799 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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