Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMN1Q16637 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMN1Q16637 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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