Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KCNMB1Q16558 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KCNMB1Q16558 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KCNMB1Q16558 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
KCNMB1Q16558 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.1 ms