Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
E2F4Q16254 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
E2F4Q16254 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
E2F4Q16254 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
E2F4Q16254 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
E2F4Q16254 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
E2F4Q16254 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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