Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC6Q16204 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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CCDC6Q16204 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC6Q16204 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC6Q16204 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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