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Protein–RNA interactions for Protein: Q15223
NECTIN1, Nectin-1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
NECTIN1
Q15223
RNU6-1131P-201
ENST00000364955
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
SNORD116-22-201
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92 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR145-201
ENST00000384967
88 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-267P-201
ENST00000516714
103 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR4743-201
ENST00000584576
69 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-495P-201
ENST00000362995
107 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.205-201
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113 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.220-201
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109 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.258-201
ENST00000364613
105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-154P-201
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106 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR593-201
ENST00000384856
100 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR610-201
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96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-402P-201
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103 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MTATP6P29-201
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132 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-180P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU7-188P-201
ENST00000517063
64 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-844P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
SNORD114-5-201
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR519C-201
ENST00000385053
87 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-1177P-201
ENST00000391058
104 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
SNORA75.1-201
ENST00000391130
148 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNA5SP63-201
ENST00000391225
112 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR4290-201
ENST00000583807
95 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
MIR371B-201
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66 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
NECTIN1
Q15223
RNY4P3-201
ENST00000365254
95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
MIR892B-201
ENST00000401279
77 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
MIR6779-201
ENST00000617283
64 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU6-675P-201
ENST00000384236
104 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
TRAJ30-201
ENST00000390507
57 nt
APPRIS P1
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNY4P30-201
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95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU7-165P-201
ENST00000458864
60 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNA5SP330-201
ENST00000517096
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU6-762P-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
MIR4667-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU6-824P-201
ENST00000363724
104 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
MIR1197-201
ENST00000408818
88 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNA5SP163-201
ENST00000410304
99 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU7-24P-201
ENST00000458867
62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
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Q15223
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Q15223
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Q15223
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111 nt
BASIC
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Q15223
SNORD114-29-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
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Q15223
MIR7-2-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
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Q15223
MIR548BB-201
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66 nt
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Q15223
MIR20A-201
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71 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNA5SP457-201
ENST00000363657
124 nt
BASIC
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NECTIN1
Q15223
MIR582-201
ENST00000365731
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NECTIN1
Q15223
MIR106A-201
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81 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
SNORD75.2-201
ENST00000408784
58 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.593-201
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98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
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93 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
AC097510.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
AC093729.1-201
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128 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
CR383656.4-201
ENST00000546909
122 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
MIR6514-201
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU6-1298P-201
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101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
SNORD114-16-201
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70 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU6-624P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU6-382P-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
AC140658.3-201
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271 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
MIR5582-201
ENST00000579697
68 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
NECTIN1
Q15223
RNU5F-1-201
ENST00000362507
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BASIC
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□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.115-201
ENST00000363272
98 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
SNORD114-4-201
ENST00000363962
75 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-929P-201
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107 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
MIR548E-201
ENST00000408287
88 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU7-159P-201
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62 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-1134P-201
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101 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
SNORA49-201
ENST00000386157
136 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6ATAC22P-201
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89 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
SNORA40.17-201
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115 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
U6.81-201
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106 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.606-201
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103 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
86 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
MIR5190-201
ENST00000581537
80 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
MIR6507-201
ENST00000613630
70 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
MIR148A-201
ENST00000362215
68 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
SNORD115-37-201
ENST00000363768
82 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-990P-201
ENST00000364385
104 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-1036P-201
ENST00000383959
104 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
TRAJ54-201
ENST00000390484
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.611-201
ENST00000410682
108 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-592P-201
ENST00000411333
103 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
AC145423.2-201
ENST00000610631
239 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
AL109933.3-201
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188 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
AC006160.2-201
ENST00000637708
154 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-208P-201
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107 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
AL450471.1-201
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127 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
AC006254.2-201
ENST00000603259
279 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
MIR2909-201
ENST00000617113
69 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
MIR4773-1-201
ENST00000637203
78 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
Y_RNA.73-201
ENST00000362910
113 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-294P-201
ENST00000364999
102 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
SNORD77.2-201
ENST00000391045
68 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
AL353795.2-201
ENST00000431804
425 nt
TSL 2
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
RNU6-1108P-201
ENST00000516308
104 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
NECTIN1
Q15223
Clostridiales-1.4-201
ENST00000636807
150 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
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