Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A3Q14050 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A3Q14050 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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