Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
IFT88Q13099 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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IFT88Q13099 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
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IFT88Q13099 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
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IFT88Q13099 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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IFT88Q13099 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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IFT88Q13099 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
IFT88Q13099 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
IFT88Q13099 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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