Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN3Q13064 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN3Q13064 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MKRN3Q13064 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MKRN3Q13064 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN3Q13064 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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