Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.9 ms