Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
E2F1Q01094 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
E2F1Q01094 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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