Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

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Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA1P56199 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ITGA1P56199 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA1P56199 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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ITGA1P56199 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA1P56199 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGA1P56199 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGA1P56199 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGA1P56199 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGA1P56199 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGA1P56199 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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ITGA1P56199 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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ITGA1P56199 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ITGA1P56199 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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