Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ECHS1P30084 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ECHS1P30084 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ECHS1P30084 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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