Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SH3BP5O60239 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SH3BP5O60239 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SH3BP5O60239 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.6 ms