Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MEIS1O00470 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MEIS1O00470 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MEIS1O00470 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MEIS1O00470 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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